2021年，美國警方在一輛車內發現黃芳彥的遺體，為他的人生劃下戲劇性的句點。法醫判定他死於頭部槍傷，屬自我結束生命，並非意外。然而外界對這項結論仍有不少疑慮。他的弟弟曾說，黃芳彥個性豁達，生前雖服用抗憂鬱藥物，但看不出有任何輕生的徵兆。另有傳聞指出，握有陳家機密的他，可能遭到不明人士介入，那些來不及說出口的秘密，也許就隨著他的離世而永遠石沉大海。
逃亡期間，台灣媒體曾披露一封黃芳彥寫給吳淑珍的「血書」，字裡行間流露深切又矛盾的情感。諸如「Promise forever，miss you so much」等語句，讀來格外沉重。有人認為，這些話既表達他願意為陳家扛下一切責任，也帶著與政治風暴切割的意味。此外，他還在血書上滴下淚水，抒發強烈的愛恨交織，令人不勝唏噓。他的人生落幕了，但留下的謎團與遺產分配問題，至今仍未解開。他累積的資產因涉案遭到凍結，部分珠寶早已成為陳家弊案的證物，其餘財產能否交到繼承人手上仍有變數。無論家屬如何爭取，這筆可觀遺產的背後，依舊是層層難解的糾葛。
黃芳彥的一生，如同權力與人性的試煉場。從意氣風發的醫師，到通緝案中的關鍵內應，既是權力腐蝕的縮影，也是人性角力下沉淪的寫照。他的故事提醒人們政商往來的分際、權力失控的後果，以及勇敢與愚忠之間那條細微的界線。一段悲涼人生，不僅沒能風光收場，還成了台灣政商圈難以抹去的陰影。黃芳彥的經歷，是一面映照現實的鏡子，也終將成為留在人們心中的警惕。